Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPSF1Q10570 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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