Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELF3P78545 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELF3P78545 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELF3P78545 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms