Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf13P61216 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf13P61216 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf13P61216 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf13P61216 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Taf13P61216 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf13P61216 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf13P61216 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf13P61216 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf13P61216 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf13P61216 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf13P61216 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms