Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms