Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXP28300 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXP28300 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXP28300 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXP28300 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms