Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GP1BBP13224 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms