Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLXNB1O43157 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PLXNB1O43157 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms