Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms