Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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