Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 913.9 ms