Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SLC20A1P2-201ENST00000618036 966 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA7-201ENST00000369297 1885 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms