Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF17Q9BXT8 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms