Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CCBE1Q6UXH8 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms