Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms