Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms