Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DNASE1-202ENST00000407479 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms