Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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