Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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ITGA9Q13797 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ITGA9Q13797 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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