Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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ALCAMQ13740 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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ALCAMQ13740 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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