Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL3Q13618 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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