Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 421.9 ms