Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms