Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms