Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PGGT1BP53609 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms