Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RNF17Q9BXT8 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms