Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTC29Q8NA56 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 459.3 ms