Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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SYNE4Q8N205 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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SYNE4Q8N205 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYNE4Q8N205 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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