Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC93Q567U6 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms