Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TRIM48-201ENST00000417545 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DTNA-209ENST00000556414 1626 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 EFCAB5-208ENST00000536908 2826 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SPRR4-201ENST00000328051 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RAB19-201ENST00000356407 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP181-201ENST00000411188 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC00525-201ENST00000412730 1188 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SEMA3B-AS1-201ENST00000421735 338 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC084851.3-201ENST00000432771 573 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC023137.1-201ENST00000448241 308 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC00265-202ENST00000448955 468 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01007-203ENST00000451953 579 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC011452.1-201ENST00000451973 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL445673.1-201ENST00000455124 416 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC008897.2-201ENST00000501886 527 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CFL1P5-201ENST00000508046 502 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RAB19-203ENST00000537763 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC126323.1-201ENST00000561706 611 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ULK4P2-205ENST00000570221 634 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ELOB-205ENST00000572954 331 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC005323.1-201ENST00000579914 569 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NOP16-208ENST00000616685 472 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 WT1-AS_1.1-201ENST00000619639 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms