Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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