Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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