Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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COL4A6Q14031 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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COL4A6Q14031 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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COL4A6Q14031 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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COL4A6Q14031 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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COL4A6Q14031 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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