Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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CDH18Q13634 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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