Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TCIRG1Q13488 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms