Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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FOXE3Q13461 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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