Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SP140Q13342 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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