Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 YAP1P2-201ENST00000455104 610 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CLN3Q13286 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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