Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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HOXD13P35453 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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HOXD13P35453 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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HOXD13P35453 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD13P35453 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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