Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRGP23470 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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