Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms