Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CLDN9O95484 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CLDN9O95484 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CLDN9O95484 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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CLDN9O95484 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CLDN9O95484 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLDN9O95484 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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