Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FANCFQ9NPI8 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms