Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LRRIQ1Q96JM4 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms