Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms