Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CUL4BQ13620 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms