Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms