Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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