Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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