Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
LINC00587B1AMM8 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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