Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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USP18Q9UMW8 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP18Q9UMW8 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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